repitools
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doi：10.18129/b9.bioc.repitools
表观基因组工具
生物导体版本：版本（3.15）
用于分析基于富集的表观基因组数据的工具。特征包括根据基因表达环境对启动子的摘要和可视化，发现差异甲基化/结合的区域，用于量化甲基化等。
作者：马克·罗宾逊（Mark Robinson）<马克·罗宾森（Mark.Robinson）在imls.uzh.ch.ch>，dario strbenac
维护者：马克·罗宾逊（Mark Robinson）<马克·罗宾森（Mark.robinson）
引用（从r内，输入引用（“ repitools”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Repitools”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Repitools”）
| R脚本 | 使用重新通信进行表观基因组测序数据 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.42.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（10。5年） |
| 执照 | LGPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 3.5.0），方法，生物基因（> = 0.8.0） |
| 进口 | 平行，S4VECTORS（> = 0.17.25），iranges（> = 2.13.12），GenomeInfodB，，，，基因组机，，，，生物弦，，，，rsamtools，，，，基因组签名，，，，rtracklayer，，，，BSGENOME（> = 1.47.3），GPLOTS， 网格，大量的，，，，gsmoothr，，，，EDGER（> = 3.4.0），DNACOPIGY，，，，林戈，，，，rsolnp，，，，簇 |
| 链接 | |
| 建议 | Shortread，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg18 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | repitools_1.42.0.tar.gz |
| Windows二进制 | repitools_1.42.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | repitools_1.42.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/repitools |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/repitools |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/repitools/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
