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反弹
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DOI：10.18129 / b9.bioc.reacreomepa.
反应途径分析
Bioconductor版本：释放（3.13）
该包提供了基于反应途径数据库的路径分析功能。它实现了富集分析，基因设定浓缩分析和一些可视化功能。
作者：广东宇[AUT，CRE]，Vladislav Petyuk [CTB]
维护者：广东宇<广东峪在Gmail.com>
引文（从R内，输入引文（“反弹”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“reactomepa”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“反弹”）
| HTML. | r script. | 反应途径分析的R包 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.36.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 2.10（R-2.15）（9年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 依靠 | r（> = 3.4.0） |
| 进口 | annotationdbi.那剂量（> = 3.5.1），纪念碑那ggplot2.那GGraph..那反弹.DB.那iGraph.那石墨 |
| 链接到 | |
| 建议 | 生物焦那ClusterProfiler.那kn那RAMAMAMDOW.那org.hs.eg.db.那prettydoc.那testthat. |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book//book// |
| Bugreports. | https://github.com/guangchuangyu/reacontomepa/issues. |
| 取决于我 | 牧师 |
| 进口我 | 生物扫描那表演那exphuntersuite.那Mirsponger.那多态石那SCTERSOR. |
| 建议我 | Chipseeker.那Cindex.那ClusterProfiler.那可乐那SCGPS. |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | 反弹_1.36.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | 反弹_1.36.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | 反弹_1.36.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/reacectomepa. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondudard.org：包/反弹 |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/reaceCtomepa/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
