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Rcwl
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DOI:10.18129 / B9.bioc.Rcwl
公共工作流语言的R接口
Bioconductor版本:发行版(3.13)
通用工作流语言(CWL)是一种用于开发数据分析工作流的开放标准，它可以跨不同的工具和工作环境进行移植和扩展。Rcwl提供了一种简单的方法来包装命令行工具，并在r中以编程方式构建CWL数据分析管道。它增加了CWL管道的使用、开发和维护的便利性。
作者:胡强[aut, cre]，刘谦[aut]
维护者:强虎<强。在roswellpark.org>
引文(从R内，输入引用(“Rcwl”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Rcwl")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“Rcwl”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | Rcwl:公共工作流语言的R接口 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(2年) |
| 许可证 | GPL-2 |文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.6)，yaml、方法、S4Vectors |
| 进口 | 跑龙套,统计数据,BiocParallel，batchtools，图，闪亮的，R.utils，codetools，蛇怪 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle |
| SystemRequirements | Python (>= 2.7)， cwltool (>= 1.0.2018) |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | RcwlPipelines |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | Rcwl_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13 (High Sierra) | Rcwl_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rcwl |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Rcwl |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Rcwl/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
