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- Bioconductor 3.13
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- Rbec
Rbec
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DOI:10.18129 / B9.bioc.Rbec
Rbec:扩增子测序数据的分析的工具从合成微生物群落
Bioconductor版本:版本(3.13)
Rbec是分析扩增子的DADA2改编版本从合成测序数据社区(同步通信卫星),在每个应变的参考序列的存在。Rbec不仅可以准确地同步通信卫星的微生物组成,但也在同步通信卫星预测污染物样品。
作者:张Pengfan (aut (cre)
维护人员:张Pengfan < pzhang在mpipz.mpg.de >
从内部引用(R,回车引用(“Rbec”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Rbec”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“Rbec”)
| HTML | R脚本 | Rbec |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.0.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(< 6个月) |
| 许可证 | LGPL-3 |
| 取决于 | |
| 进口 | Rcpp(> = 1.0.6),dada2,ggplot2,readr,doParallel,foreach,统计grDevices跑龙套 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | Rbec_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Rbec_1.0.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | Rbec_1.0.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Rbec |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Rbec |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Rbec/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
