生物导体版本:版本(3.12)
该软件包提供了适合基因组位置数据的副本编号,突变和其他数据的灵活表示。此类数据的基本表示为用户提供了一个矩形平桌接口,并在列中的行和样本/标本中提供了范围信息。
作者:Martin Morgan [AUT,CRE],Marcel Ramos [AUT]
维护者:Martin Morgan
引用(从r内,输入引用(“ raggedexperiment”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ raggedexperiment”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ raggedexperiment”)
html | R脚本 | 破烂的经历 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.14.2 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(4年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 3.6.0),基因组机(> = 1.37.17) |
进口 | 生物基因,,,,GenomeInfodB,,,,iranges,,,,矩阵,,,,矩阵, 方法,S4VECTORS,统计总结性特征 |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,多亚sayExexperiment |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/bioconductor/raggedexperiment/issues |
取决于我 | cnvranger,,,,txreginfra |
进口我 | cbioportaldata,,,,OMICSPRINT,,,,rtcgatoolbox,,,,tcgautils |
建议我 | 策展,,,,多亚sayExexperiment,,,,多胎 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | raggedexperiment_1.14.2.tar.gz |
Windows二进制 | raggedexperiment_1.14.2.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | raggedexperiment_1.14.2.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/raggedexperiment |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/raggedexperiment |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/raggedexperiment/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
Bioc 3.12的旧源软件包 | 来源存档 |