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ROSeq
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ROSeq
scRNA-Seq数据的耐噪声差异表达分析的表达等级建模
Bioconductor版本:Release (3.15)
ROSeq -一种基于秩的方法来建模基因表达过滤和标准化的读计数矩阵。ROSeq以过滤后归一化的read matrix和cell-annotation/condition作为输入，确定对比组单细胞之间的差异表达基因。其中一个输入参数是要使用的核数。
作者:Krishan Gupta [aut, cre]， Manan Lalit [aut]， Aditya Biswas [aut]， Abhik Ghosh [aut]， Debarka Sengupta [aut]
维护者:Krishan Gupta
引文(从R内，输入引用(“ROSeq”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“ROSeq”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | ROSeq |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.11 (R-4.0)(2年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.0) |
| 进口 | pbmcapply，刨边机，limma |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown，testthat，RUnit，BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/krishan57gupta/ROSeq |
| BugReports | https://github.com/krishan57gupta/ROSeq/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | ROSeq_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ROSeq_1.8.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | ROSeq_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ROSeq |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ROSeq |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ROSeq/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
