rnaprobr

doi:10.18129/b9.bioc.rnaprobr

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

用于分析基于大规模平行测序的RNA结构探测数据的R包装

生物导体版本:版本(3.13)

该软件包促进了对下一代测序数据的分析,该数据的位置信息具有单个核苷酸分辨率是关键。它允许在表或UCSC兼容的床上图文件中应用不同类型的相关正常化,数据可视化和导出。

作者:lukasz jan kielpinski ,Nikos sidiropoulos at gmail.com>,jeppe vinther

维护者:nikos sidiropoulos

引用(从r内,输入引用(“ rnaprobr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rnaprobr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

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版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(6年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.1.1),GenomicFeatures(> = 1.16.3),plyr(> = 1.8.1),生物基因(> = 0.10.0)
进口 生物弦(> = 2.32.1),基因组机(> = 1.16.4),iranges(> = 2.10.5),rsamtools(> = 1.16.1),rtracklayer(> = 1.24.2),基因组签名(> = 1.5.12),S4VECTORS(> = 0.14.7),图形,统计,utils
链接
建议 生物使用
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rnaprobr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/rnaprobr
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/rnaprobr/
软件包下载报告 下载统计

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