ramodr.

DOI：10.18129 / b9.bioc.ramodr.

检测高吞吐量测序数据中的转录后修改

Bioconductor版本：释放（3.13）

rnamodr提供来自高跟序测序的加载/聚合数据的类和工作流程，其旨在通过分析特定模式来检测转录后修改。此外，提供实用程序以验证和可视化结果。rnamodr包提供了一种核心功能，可以从中实现特定的分析策略作为单独的包装。

作者：Felix上午ernst [aut，cre]，丹尼斯L.J.Lafontaine [CTB，FND]

维护者：Felix上午ernst

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“rnamodr”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“rnamodr”）

HTML.	r script.	ramodr.
HTML.	r script.	Ramodr - 为新检测策略创建新课程
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细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.6.0
在生物导体中以来	BIOC 3.10（R-3.6）（1.5年）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 4.0），S4Vectors.（> = 0.27.12），绞喉（> = 2.23.9），Genomicranges.那modstrings.
进口	方法，统计，Grdevices，MatrixStats.那生物根系那生物仪器（> = 2.57.2），生物相投那基因组法那基因管理那genomeinfodb.那rtracklayer.那RSAMTOOLS.那bsgenome.那rcolorbrewer.那托罗拉姆斯那ggplot2.那GVIZ.（> = 1.31.0），重塑2.，图形，r
链接到
建议	生物焦那kn那RAMAMAMDOW.那testthat.那rnamodr.data.
系统要求
加强
URL.	https://github.com/felixernster/ramodr.
Bugreports.	https://github.com/felixernster/ramodr/sissues.
取决于我	rnamodr.allanilineseq.那rnamodr.ml.那rnamodr.Ribomethseq.
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	rnamodr_1.6.0.tar.gz.
Windows二进制文件	rnamodr_1.6.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	rnamodr_1.6.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/ramodr.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/ ramodr
包短网址	https://biocumon.org/packages/ramodr/
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