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RNAinteract
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DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAinteract
从多维特征估计成对相互作用
Bioconductor版本:发行版(3.16)
rninteraction通过从图像中提取的特征等多维读出来估计遗传相互作用。筛管假定采用多孔板或类似设计。从每个孔的特征列表(例如细胞数量、面积、荧光强度)开始，估计遗传相互作用。该软件包提供了报告相互作用基因对、绘制热图和双RNAi图的功能。可以为质量控制和分析编写HTML报告。
作者:Bernd Fischer [aut]， Wolfgang Huber [ctb]， Mike Smith [cre]
维护者:Mike Smith < Mike。史密斯在embl.de>
引文(从R内，输入引用(“RNAinteract”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“RNAinteract”)
| R脚本 | RNAinteract | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.46.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.8 (R-2.13)(12年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 2.12.0) |
| 进口 | RColorBrewer，ICS，ICSNP，cellHTS2，geneplotter，gplots、网格hwriter，晶格，latticeExtra，limma、方法、splots(> = 1.13.12),abind，locfit，Biobase |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | RNAinteractMAPK |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | RNAinteract_1.46.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RNAinteract_1.46.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | RNAinteract_1.46.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | RNAinteract_1.46.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAinteract |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ rninteract |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/RNAinteract/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAinteract/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
