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REDseq
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DOI:10.18129 / B9.bioc.REDseq
高通量测序数据的分析处理限制性内切酶消化
Bioconductor版本:版本(3.16)
包包含函数建立限制酶切位点(RECS)地图,分发映射序列与五种不同的方法,在地图上找到丰富/耗尽推荐一个样本,识别不同浓缩/耗尽样本之间的推荐。
作者:丽华朱莉·朱Junhui李和托马斯•Fazzio
维护人员:丽华朱莉朱<朱莉。朱:umassmed.edu >
从内部引用(R,回车引用(“REDseq”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“REDseq”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“REDseq”)
| R脚本 | REDseq装饰图案 | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.44.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.9 (r - 2.14)(11年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.5.0),BiocGenerics,BSgenome.Celegans.UCSC.ce2,乘,Biostrings,BSgenome,ChIPpeakAnno |
| 进口 | AnnotationDbi、图形、IRanges(> = 1.13.5)统计,跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
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| 取决于我 | |
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| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | REDseq_1.44.0.tar.gz |
| Windows二进制 | REDseq_1.44.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | REDseq_1.44.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | REDseq_1.44.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/REDseq |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ REDseq |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/REDseq/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/REDseq/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
