RCY3
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
doi：10.18129/b9.bioc.rcy3
访问和控制Cytoscape的功能
生物导体版本：版本（3.15）
使用Cytoscape通过R的R. Vizualize，分析和探索网络。您可以使用Cytoscape的图形用户界面可以完成任何操作，现在可以使用单个RCY3函数来完成。
作者：Alex Pico [AUT，CRE]
，Tanja Muetze [Aut]，Paul Shannon [AUT]，Ruth Isserlin [CTB]，Shraddha Pai [CTB]，Julia Gustavsen [CTB]，Georgi Kolishovski [CTB]，Yihang Xin [CTB [CTB [CTB] [CTB] [CTB]
维护者：Alex pico
引用（从r内，输入引用（“ RCY3”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ RCY3”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ RCY3”）
| html | R脚本 | 01. RCY3〜25分钟的概述 |
| html | R脚本 | 02. Cytoscape和Igraph〜5分钟 |
| html | R脚本 | 03. Cytoscape和Graphnel〜5分钟 |
| html | R脚本 | 04.导入数据〜5分钟 |
| html | R脚本 | 05.网络功能和可视化〜15分钟 |
| html | R脚本 | 06.癌症网络和数据〜40分钟 |
| html | R脚本 | 07.标识符映射〜20分钟 |
| html | R脚本 | 08.升级现有脚本〜15分钟 |
| html | R脚本 | 09. Cytoscape和Ndex〜20分钟 |
| html | R脚本 | 10.组节点〜15分钟 |
| html | R脚本 | 11.自定义图形和标签〜10分钟 |
| html | R脚本 | 12.过滤网络〜10分钟 |
| html | R脚本 | 13.系统发育〜3分钟 |
| html | R脚本 | 14. Jupyter桥和RCY3〜10分钟 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.16.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.2（R-3.2）（7年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | |
| 进口 | httr， 方法，rjsonio，，，，XML，utils，生物基因，统计图形，，，，FS，，，，UUID，，，，Uchardet，，，，胶水，，，，rcurl，，，，Base64url，，，，base64enc，，，，Irkernel，，，，irdisplay，，，，rcolorbrewer |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，Igraph，grdevices |
| 系统要求 | Cytoscape（> = 3.7.1），Cyrest（> = 3.8.0） |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/cytoscape/rcy3 |
| BugReports | https://github.com/cytoscape/rcy3/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 类别Compare，，，，CETF，，，，受够了，，，，Mogamun，，，，ncigraph，，，，Netzoor，，，，Regutools，，，，Timirgen，，，，Transomics2Cytoscape |
| 建议我 | 石墨，，，，netdx，，，，rscudo |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | RCY3_2.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | rcy3_2.16.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | RCY3_2.16.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rcy3 |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/rcy3 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rcy3/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
