RCM

DOI:10.18129 / B9.bioc.RCM

适合row-column协会与微生物的负二项分布模型

Bioconductor版本:版本(3.13)

结合对数线性的想法列联表分析,灵活的响应函数估计和分散经验贝叶斯估计对探险的微生物组数据集的可视化。包包括无约束以及约束分析。

作者:Stijn Hawinkel < Stijn。在ugent.be hawinkel >

维护人员:约最大经济产量<尤里斯。最大经济产量在ugent.be >

从内部引用(R,回车引用(RCM)):

安装

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如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(RCM)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

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细节

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版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (r - 3.6)(2年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 3.6.0)
进口 RColorBrewer,阿拉巴马州,刨边机,reshape2,tseries,VGAM,ggplot2(> = 2.2.1.9000),nleqslv,phyloseq,张量,质量统计,grDevices、图形的方法
链接
建议 knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com/packages/release/bioc/vignettes/RCM/inst/doc/RCMvignette.html/
BugReports https://github.com/CenterForStatistics-UGent/RCM/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 RCM_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 RCM_1.8.0.zip(64位)
macOS 10.13(高山脉) RCM_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RCM
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RCM
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RCM/
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