QSutils

DOI:10.18129 / B9.bioc.QSutils

准物种多样性

生物导体版本:发布(3.13)

利用NGS数据进行病毒准种分析的效用函数集。大多数功能对于宏基因组研究同样有用。主要有三种类型:(1)数据操作和探索功能，用于将读数据转换为单倍型和频率，修复读数据，交叉单倍型，以及可视化单倍型排列。(2)多样性指数——计算多样性和熵的函数，其中考虑了关联、丰度和功能指数。(3)数据模拟——用于生成随机病毒准种数据的函数。

作者:Mercedes Guerrero-Murillo [cre, aut]， Josep Gregori Font [aut]

维护者:Mercedes Guerrero-Murillo

安装

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细节

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版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R (> = 3.5),Biostrings,BiocGenerics、方法
进口	猿统计数据,心理
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,ggplot2
SystemRequirements
增强了
URL
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	QSutils_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	QSutils_1.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	QSutils_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/QSutils
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ QSutils
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/QSutils/
包下载报告	下载数据