生物导体版本:版本(3.15)
QFeatures基础架构可以为高通量质谱分析的定量特征进行管理和处理。它提供了熟悉的生物导体用户体验,可以以相干且可拖动的格式管理不同测定水平(例如肽光谱匹配,肽和蛋白质)的定量数据。
作者:Laurent Gatto [AUT,CRE],Christophe Vanderaa [aut]
维护者:laurent Gatto
引用(从r内,输入引用(“ qfeatures”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ qfeatures”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Qfeatures”)
html | R脚本 | 来自qfeatures对象的数据可视化 |
html | R脚本 | 处理定量蛋白质组学数据与qfeatures |
html | R脚本 | 质谱数据的定量特征 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.6.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 4.0),多亚sayExexperiment |
进口 | 方法,统计,utils,S4VECTORS,,,,iranges,,,,总结性特征,,,,生物基因,,,,蛋白质(> = 1.19.3),AnnotationFilter,,,,懒惰,,,,生物酶,,,,mscoreutils(> = 1.1.2),Igraph,,,,情节 |
链接 | |
建议 | Singlecellexperiment,,,,HDF5Array,,,,MSDATA,,,,GGPLOT2,,,,GPLOTS,,,,dplyr,,,,林玛,,,,马格里特,,,,DT,,,,闪亮的,,,,发光的dashboard,,,,测试,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,VSN,,,,预处理,,,,矩阵,,,,IMPUTELCMD,,,,pcamethods,,,,算,,,,规范,,,,复杂的图像 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/rformassspectrometry/qfeatures |
BugReports | https://github.com/rformassspectrometry/qfeatures/issues |
取决于我 | MSQROB2,,,,SCP,,,,scpdata |
进口我 | 代谢通道,,,,psmatch |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | qfeatures_1.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | qfeatures_1.6.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | qfeatures_1.6.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qfeatures |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/qfeatures |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/qfeatures/ |
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