ping

doi:10.18129/b9.bioc.ping

用基于MNase或超声的短阅读数据对核小体定位的概率推断

生物导体版本:版本(3.15)

使用经验贝叶斯混合模型方法对CHIP-SEQ的概率推断。

作者:Xuekui Zhang ,Raphael Gottardo ,sangsoon woo

维护者:renan sauteraud

引用(从r内,输入引用(“ ping”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ ping”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

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细节

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版本 2.40.0
在生物导体中 Bioc 2.10(R-2.15)(10。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.5.0)
进口 方法,图片,图形,grdevices,Stats,GVIZ,,,,FDA,,,,BSGENOME,stats4,生物基因,,,,iranges,,,,基因组机,,,,S4VECTORS
链接
建议 平行,Shortread,,,,rtracklayer
系统要求
增强
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取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 ping_2.40.0.tar.gz
Windows二进制 ping_2.40.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) ping_2.40.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ping
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/ping
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/ping/
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