PFP

doi：10.18129/b9.bioc.pfp

r r的路径指纹框架

生物导体版本：版本（3.15）

纸质指纹框架的实现，该途径框架在纸质“途径指纹：一种基于生物标志物发现和表征的基于新型途径知识和拓扑的方法”中引入。该方法提供了基因集（例如差异表达基因列表）和经过良好研究的“基本途径网络”（KEGG途径）之间的系统比较，从而测量了途径和基因对基因集的重要性。该软件包对于研究人员找到生物标志物及其功能很有帮助。

作者：XC Zhang [AUT，CRE]

维护者：XC Zhang

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ pfp”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ PFP”）

html	R脚本	途径指纹：基于基因表达数据和途径知识的生物标志物发现工具
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1。5年）
执照	GPL-2
要看	R（> = 4.0）
进口	图形，，，，Igraph，，，，kegggraph，，，，clusterProfiler，，，，GGPLOT2，，，，plyr，，，，花花公子，，，，马格里特，统计，方法，utils
链接
建议	尼特，，，，测试，，，，rmarkDown，，，，org.hs.eg.db
系统要求
增强
URL	https://github.com/aib-group/pfp
BugReports	https://github.com/aib-group/pfp/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	pfp_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	pfp_1.4.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	pfp_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pfp
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/pfp
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/pfp/
软件包下载报告	下载统计