完美的

DOI:10.18129 / B9.bioc.PERFect

排列为微生物数据过滤

Bioconductor版本:版本(3.15)

完美是一种新型的排列过滤方法旨在解决微生物数据处理两个有待解决的问题:(i)定义和量化损失过滤通过实现阈值,和(2)介绍和评估一个排列测试过滤损失提供一定程度的过度的过滤。

作者:Ekaterina Smirnova <叶。曹smirnova vcuhealth.org >, Quy < Quy。曹:umontana.edu >

维护人员:Quy曹< Quy。曹:umontana.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“完美”)

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文档

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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6.0),sn(> = 1.5.2)
进口	ggplot2(> = 3.0.0),phyloseq(> = 1.28.0),动物园(> = 1.8.3),心理(> = 1.8.4),数据(> = 3.6.0),矩阵(> = 1.2.14),fitdistrplus(> = 1.0.12)、并行(> = 3.6.0)
链接
建议	knitr,rmarkdown,kableExtra,ggpubr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/cxquy91/PERFect
BugReports	https://github.com/cxquy91/PERFect/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	PERFect_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	PERFect_1.10.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	PERFect_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PERFect
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/完美的
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PERFect/
包下载报告	下载数据