生物导体版本:发布(3.13)
该包实现了PAIRADISE程序,用于检测配对RNA-Seq数据中匹配复制之间的差异亚型表达。
作者:Levon Demirdjian,吴应年,易兴
维护者:胡强<强。Hu在roswellpark.org>, Levon Demirdjian
引文(从R中输入引用(“PAIRADISE”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装BiocManager::install("PAIRADISE")
有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“PAIRADISE”)
超文本标记语言 | R脚本 | PAIRADISE |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.8.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.9 (R-3.6)(2年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.6),nloptr |
进口 | SummarizedExperiment,S4Vectors、统计数据、方法abind,BiocParallel |
链接 | |
建议 | testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | PAIRADISE_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | PAIRADISE_1.8.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | PAIRADISE_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PAIRADISE |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PAIRADISE |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PAIRADISE/ |
包下载报告 | 下载数据 |