PAIRADISE

DOI:10.18129 / B9.bioc.PAIRADISE

配对分析:差异异构体表达

生物导体版本:发布(3.13)

该包实现了PAIRADISE程序,用于检测配对RNA-Seq数据中匹配复制之间的差异亚型表达。

作者:Levon Demirdjian,吴应年,易兴

维护者:胡强<强。Hu在roswellpark.org>, Levon Demirdjian

引文(从R中输入引用(“PAIRADISE”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("PAIRADISE")

有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“PAIRADISE”)

超文本标记语言 R脚本 PAIRADISE
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R (> = 3.6),nloptr
进口 SummarizedExperimentS4Vectors、统计数据、方法abindBiocParallel
链接
建议 testthatknitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 PAIRADISE_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 PAIRADISE_1.8.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) PAIRADISE_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PAIRADISE
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PAIRADISE
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PAIRADISE/
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