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Oscope
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DOI:10.18129 / B9.bioc.Oscope
Oscope——统计管道识别振荡在同步的单细胞RNA-seq基因
Bioconductor版本:版本(3.13)
Oscope是统计管道开发识别和恢复基本周期的振荡基因在非同步单细胞RNA-seq实验。Oscope管道包括三个模块:一个正弦模型模块搜索候选人振荡器对;K-medoids集群模块集群候选人振荡器组;和一个扩展的插入模块恢复基本周期为每个振荡器组。
作者:宁愣了
维护人员:宁愣了< lengning1 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“Oscope”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Oscope”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“Oscope”)
| R脚本 | Oscope_vigette | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.22.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.2 (r - 3.2)(5.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | EBSeq,集群,testthat,BiocParallel |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | Oscope_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Oscope_1.22.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | Oscope_1.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Oscope |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Oscope |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Oscope/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
