有机体

doi:10.18129/b9.bioc.ormanismdbi

软件可以使不同数据库软件包的平稳接口

生物导体版本:版本(3.13)

该软件包可以通过利用这些软件包实现选择方法的事实来实现一个简单的统一接口到几个具有自己的架构的注释软件包。

作者:马克·卡尔森(Marc Carlson),赫维·帕格斯(HervéPagès),马丁·摩根(Martin Morgan)

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“有机体”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ astrymismdbi”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“生物体”)

PDF R脚本 有机体:注释包的元框架
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.34.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(8。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 2.14.0),方法,生物基因(> = 0.15.10),AnnotationDbi(> = 1.33.15),GenomicFeatures(> = 1.39.4)
进口 生物酶,,,,生物管理器,,,,基因组机(> = 1.31.13),图形,,,,iranges,,,,rbgl,,,,DBI,,,,S4VECTORS(> = 0.9.25),统计
链接
建议 同性恋,,,,rattus.norvegicus,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,AnnotationHub,,,,fdb.ucsc.trnas,,,,mirbase.db,,,,rtracklayer,,,,Biomart,,,,运行,,,,rmariaDB
系统要求
增强
URL
取决于我 同性恋,,,,mus.musculus,,,,rattus.norvegicus
进口我 AnnotationHubdata,,,,epivizrdata,,,,GGBIO,,,,GPART,,,,发现
建议我 Chippeakanno,,,,EPIVIZRSTANTALLONE
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Armisismdbi_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 有机体dbi_1.34.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) 有机体dbi_1.34.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/organismdbi
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/astryismdbi
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/organismdbi/
软件包下载报告 下载统计

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