OncoScore

DOI:10.18129 / B9.bioc.OncoScore

识别潜在致癌基因的工具

Bioconductor版本:Release (3.15)

OncoScore是一种基于生物医学文献引用频率来衡量基因与癌症关联的工具。评分通过动态更新的网络查询从PubMed文献中评估。

作者:卢卡·德·萨诺[aut],卡洛·甘巴科蒂·帕萨利尼[ctb],罗科·皮亚扎[ctb],丹尼尔·拉马佐蒂[cre, aut],罗伯塔·斯皮内利[ctb]

维护者:Luca De Sano

引文(从R内,输入引用(“OncoScore”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“OncoScore”)

PDF R脚本 OncoScore
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

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版本 1.24.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(6年)
许可证 文件许可证
取决于 R (>= 4.1.0)
进口 biomaRt, grDevices,图形,utils,方法
链接
建议 BiocGenericsBiocStyleknitrtestthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/danro9685/OncoScore
BugReports https://github.com/danro9685/OncoScore
全靠我
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 OncoScore_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 OncoScore_1.24.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) OncoScore_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OncoScore
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/OncoScore
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/OncoScore/
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