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OmaDB
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DOI:10.18129 / B9.bioc.OmaDB
R OMA REST API包装器
Bioconductor版本:版本(3.15)
一个包从数据库OMA orthology预测数据的下载。
作者:美妙的Kaleb
维护人员:美妙的Kaleb <美妙。kaleb18 ic.ac。Adrian Altenhoff英国>,<艾德里安。在inf.ethz.ch altenhoff >
从内部引用(R,回车引用(“OmaDB”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“OmaDB”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“OmaDB”)
| HTML | R脚本 | 探索层次与OmaDB同源组 |
| HTML | R脚本 | 探索与OmaDB分类树 |
| HTML | R脚本 | 开始使用OmaDB |
| HTML | R脚本 | 序列映射OmaDB |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.12.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(4年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.5),httr(> = 1.2.1),plyr(> = 1.8.4) |
| 进口 | 跑龙套,猿,Biostrings,GenomicRanges,IRanges、方法、topGO,jsonlite |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/DessimozLab/OmaDB |
| BugReports | https://github.com/DessimozLab/OmaDB/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | PhyloProfile |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | OmaDB_2.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | OmaDB_2.12.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | OmaDB_2.12.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OmaDB |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ OmaDB |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/OmaDB/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
