OVESEG

DOI:10.18129 / B9.bioc.OVESEG

OVESEG-test检测组织/细胞特异性标记物

Bioconductor版本:发行版(3.16)

用于多组比较的R包,以检测亚型之间的组织/细胞特异性标记基因。它提供了计算OVESEG-test统计数据的函数,在混合零分布模型中推导组件权重,并从加权聚合排列中估计p值。得到的成分零假设的后验概率也可以刻画子类型间的各种上调模式。

作者:陈璐璐

维护人员:Lulu Chen

引文(从R内,输入引用(“OVESEG”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“OVESEG”)

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细节

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版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.9 (R-3.6)(3.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.6)
进口 统计,效用,方法,BiocParallelSummarizedExperimentlimmafdrtoolRcpp
链接 Rcpp
建议 knitrrmarkdownBiocStyletestthatggplot2gridExtra、网格reshape2尺度
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL
BugReports https://github.com/Lululuella/OVESEG
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 OVESEG_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 OVESEG_1.14.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64) OVESEG_1.14.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) OVESEG_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OVESEG
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/OVESEG
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/OVESEG/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/OVESEG/
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