OSAT

DOI:10.18129 / B9.bioc.OSAT

OSAT:最优样本分配的工具

Bioconductor版本:版本(3.16)

相当大的基因组学研究,如微阵列通常包括使用多个批次实验(集团)由于实际的并发症。批处理的影响降到最低,仔细实验设计应该保证均匀分布的生物组织和各批次的混杂因素。OSAT(最优样本分配工具)是为了便于收集样品的分配到不同的批次。用最小的步骤,它产生的设置,优化样品的均匀分布在生物兴趣分组到不同的批次,减少混淆或感兴趣的批次和生物变量之间的相关性。它甚至还可以优化分配各批次的混杂因素。我们的工具可以处理具有挑战性的情况不完整和不平衡样本集合RCBD以及理想的平衡。OSAT提供了一些预定义布局的一些最常用的基因组平台。可以在http://www.biomedcentral.com/1471-2164/13/689找到相关论文。

作者:李岩

维护人员:李岩<李。燕在roswellpark.org >

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“OSAT”)

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细节

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版本	1.46.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(10.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法,统计数据
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建议	xtable,Biobase
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URL	http://www.biomedcentral.com/1471-2164/13/689
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包档案

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源包	OSAT_1.46.0.tar.gz
Windows二进制	OSAT_1.46.0.zip
macOS二进制(x86_64)	OSAT_1.46.0.tgz
macOS二进制(arm64)	OSAT_1.46.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OSAT
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ OSAT
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/OSAT/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/OSAT/
包下载报告	下载数据