食人魔

DOI:10.18129 / B9.bioc.OGRE

计算、可视化和分析基因重叠区域

Bioconductor版本:版本(3.16)

怪物数据集计算重叠用户定义的基因组区域。任何地区都可以提供即基因单核苷酸多态性,或读取从测序实验。关键数据帮助分析重叠的扩展也可以可视化在基因组水平上。

作者:斯文berr (aut (cre), Jorg Gromoll[所有],马吕斯Woste[所有],莎拉Sandmann[所有],桑德拉Laurentino(施)

维护人员:斯文berr < svenbioinf gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“食人魔”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“食人魔”)

HTML	R脚本	食人魔
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1.0),S4Vectors
进口	GenomicRanges、方法、data.table,为了,ggplot2,Gviz,IRanges,AnnotationHubgrDevices统计数据,GenomeInfoDb,闪亮的,shinyFiles,DT,rtracklayer,shinydashboard,shinyBS,tidyr
链接
建议	testthat(> = 3.0.0),knitr(> = 1.36),rmarkdown(> = 2.11)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/svenbioinf/OGRE/
BugReports	https://github.com/svenbioinf/OGRE/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	OGRE_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	OGRE_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	OGRE_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	OGRE_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OGRE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/怪物
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/OGRE/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/OGRE/
包下载报告	下载数据