奥得河

DOI:10.18129 / B9.bioc.ODER

优化表达区域的定义

Bioconductor版本:版本(3.16)

奥得河的目的是确定先前未经表示区域(ERs)使用RNA-sequencing数据。为此,奥得河定义和优化人的定义,然后使用结连接这些人的基因数据。这样,奥得河改善基因注释。许多生物基因注释是一个主要的输入管道和一个更完整的基因注释可以使更准确的解释疾病相关变异。

作者:阿Olagbaju (aut),大卫·张(aut (cre)Sebastian Guelfi[所有],哈斯Sethi(施)

维修工:David Zhang < david.zhang。12在ucl.ac.uk >

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细节

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版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1)
进口	BiocGenerics,BiocFileCache,dasper,derfinder,dplyr,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,ggplot2,ggpubr,ggrepel,magrittr,rtracklayer,S4Vectors,stringr,data.table,megadepth、方法、plyr,purrr,宠物猫,跑龙套
链接
建议	BiocStyle,covr,knitr,重新计票,RefManageR,rmarkdown,sessioninfo,SummarizedExperiment,testthat(> = 3.0.0),GenomicFeatures,xfun
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/eolagbaju/ODER
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/ODER
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源包	ODER_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	ODER_1.4.0.zip
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ODER
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/奥得河
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ODER/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ODER/
包下载报告	下载数据