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NormalyzerDE
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DOI:10.18129 / B9.bioc.NormalyzerDE
评价归一化方法，计算微分表达式分析统计量
Bioconductor版本:发行版(3.13)
NormalyzerDE为基于LC-MS的表达数据提供归一化方法筛选。它使用现有方法和新的时间分段方法计算一系列标准化矩阵，计算性能度量并生成评估报告。此外，它为基于Limma或ANOVA的差异表达分析提供了一个简单的实用程序。
作者:Jakob Willforss
维护者:Jakob Willforss < Jakob。Willforss在hotmail.com>
引文(从R内，输入引用(“NormalyzerDE”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("NormalyzerDE")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“NormalyzerDE”)
| R脚本 | 差异表达和使用NormalyzerDE对抗技术偏差 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.6) |
| 进口 | vsn，preprocessCore，limma，质量，猿，车，ggplot2、方法、Biobase，RcmdrMisc，光栅， utils，统计，SummarizedExperiment，matrixStats，ggforce |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，testthat，rmarkdown，roxygen2，hexbin，BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/ComputationalProteomics/NormalyzerDE |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | NormalyzerDE_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | NormalyzerDE_1.10.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | NormalyzerDE_1.10.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NormalyzerDE |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NormalyzerDE |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NormalyzerDE/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
