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NeuCA
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DOI:10.18129 / B9.bioc.NeuCA
基于神经网络的单细胞注释工具
Bioconductor版本:发行版(3.16)
NeuCA是一种基于神经网络的scRNA-seq数据标注方法。它可以根据单元格类型的相关性自动调整分类策略，准确地标注单元格。NeuCA可以通过层次树自动利用单元类型的结构信息，提高标注精度。当数据包含密切相关的细胞类型时，它尤其有用。
作者:李子怡[aut]，冯昊[aut, cre]
维护:郝峰
引文(从R内，输入引用(“NeuCA”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“NeuCA”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | NeuCA包使用指南 |
| 参考手册 |
细节
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| 版本 | 1.4.0 |
| 在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 3.5.0)，keras，limma，e1071，SingleCellExperiment |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，rmarkdown，networkD3 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | NeuCA_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | NeuCA_1.4.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | NeuCA_1.4.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NeuCA |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NeuCA |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/NeuCA/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NeuCA/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
