Nebulosa

DOI:10.18129 / B9.bioc.Nebulosa

基于核基因加权密度估计的单细胞数据可视化

Bioconductor版本:发行版(3.16)

该软件包提供了基于基因加权密度估计的单细胞数据的增强可视化。星云从缺失的特征中恢复信号，并允许从多个特征(例如基因)检查联合表达。Seurat和singlecel实验对象可以在星云中使用。

作者:Jose Alquicira-Hernandez [aut, cre]

维护者:Jose Alquicira-Hernandez

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Nebulosa”)

超文本标记语言	R脚本	Nebulosa基因表达的可视化
超文本标记语言	R脚本	Nebulosa基因表达可视化(Seurat)
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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.0)，ggplot2,拼接而成
进口	修拉,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,ks,矩阵、统计数据、方法
链接
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,covr,嘘,食物,DropletUtils,igraph,BiocFileCache,SeuratObject
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/powellgenomicslab/Nebulosa
BugReports	https://github.com/powellgenomicslab/Nebulosa/issues
全靠我
进口我
建议我	scCustomize, SCpubr
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	Nebulosa_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	Nebulosa_1.8.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	Nebulosa_1.8.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	Nebulosa_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Nebulosa
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ nebula
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/Nebulosa/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Nebulosa/
软件包下载报告	下载数据