- 首页
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- 纳米管
纳米管
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoTube
一种简单的纳米串计数器数据分析管道
Bioconductor版本:发行版(3.16)
NanoTube包括处理、质量控制、分析和NanoString nCounter数据可视化的功能。分析功能包括差分分析和基因集分析方法，以及有助于理解结果的后处理步骤。附加功能包括与其他Bioconductor NanoString数据分析包的互操作性。
作者:Caleb Class [cre, aut]
，凯登·卢坎[ctb]
维护者:Caleb Class
引文(从R内，输入引用(“纳米管”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“纳米管”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 纳米管装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在Bioconductor | bio3.14 (R-4.1)(1年) |
| 许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 4.1)，Biobase，ggplot2，limma |
| 进口 | fgsea、方法、重塑，统计，效用 |
| 链接 | |
| 建议 | 网格,kableExtra，knitr，NanoStringDiff，pheatmap，情节，rlang，rmarkdown，ruv，RUVSeq，闪亮的，testthat，xlsx |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | NanoTube_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | NanoTube_1.4.0.zip |
| macOS二进制文件(x86_64) | NanoTube_1.4.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | NanoTube_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoTube |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NanoTube |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/NanoTube/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NanoTube/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
