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NanoStringNCTools
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DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringNCTools
NanoString nCounter工具
Bioconductor版本:Release (3.15)
纳米串技术工具nCounter技术。提供将RCC文件读入ExpressionSet派生对象的支持。还包括方法的质量控制和标准化的纳米串数据。
作者:Patrick Aboyoun [aut]， Nicole Ortogero [cre]， zhiyang [ctb]
维护者:Nicole Ortogero
引文(从R内，输入引用(“NanoStringNCTools”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“NanoStringNCTools”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 介绍nanostringccset类 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.4.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1年) |
| 许可证 | 麻省理工学院 |
| 取决于 | R (>= 3.6)，Biobase，S4Vectors，ggplot2 |
| 进口 | BiocGenerics，Biostrings，ggbeeswarm，ggiraph，ggthemesgrDevices,IRanges、方法、pheatmap，RColorBrewer，统计，效用 |
| 链接 | |
| 建议 | biovizBase，ggbio，RUnit，rmarkdown，knitr，qpdf |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | GeomxTools，GeoMxWorkflows |
| 进口我 | GeoDiff |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | NanoStringNCTools_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | NanoStringNCTools_1.4.0.zip(64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | NanoStringNCTools_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringNCTools |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NanoStringNCTools |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NanoStringNCTools/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
