纳米塞维兹

doi:10.18129/b9.bioc.nanomethviz

可视化牛津纳米孔测序的甲基化数据

生物导体版本:版本(3.15)

纳米塞维兹(NanoMethviz)是一种用于可视化牛津纳米孔测序的甲基化数据的工具包。它可用于探索来自牛津纳米孔直接DNA测序的读物的甲基化模式,并由包括纳米波利斯,F5C和Megalodon在内的呼叫者称为甲基化。该软件包中的图允许可视化实验组和基因组特征类别汇总的甲基化谱。

作者:Shian Su [Cre,Aut]

维护者:shian su

引用(从r内,输入引用(“纳米塞维兹”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ NanoMethviz”)

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文档

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细节

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版本 2.2.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 Apache许可证(> = 2.0)
要看 R(> = 4.0.0),方法,GGPLOT2
进口 CPP11(> = 0.2.5),readr,,,,S4VECTORS,,,,总结性特征,,,,生物兴奋,,,,BSSEQ,,,,福卡,,,,断言,,,,AnnotationDbi,,,,RCPP,,,,dplyr,,,,Data.Table,,,,E1071,,,,FS,,,,基因组机,,,,胶水,,,,林玛(> = 3.44.0),拼布,,,,purrr,,,,rlang,,,,rsqlite,,,,rsamtools,,,,,,,,Scico,统计Stringr,,,,蒂布尔,,,,花花公子,utils,,,,,Zlibbioc
链接 RCPP
建议 DSS,,,,mus.musculus,,,,同性恋,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 3.0.0),COVR
系统要求 C ++ 11
增强
URL https://github.com/shians/nanomethviz
BugReports https://github.com/shians/nanomethviz/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

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源包 nanomethviz_2.2.0.tar.gz
Windows二进制 nanomethviz_2.2.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) nanomethviz_2.2.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nanomethviz
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/nanomethviz
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/nanomethviz/
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