纳米塞维兹
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doi：10.18129/b9.bioc.nanomethviz
可视化牛津纳米孔测序的甲基化数据
生物导体版本：版本（3.15）
纳米塞维兹（NanoMethviz）是一种用于可视化牛津纳米孔测序的甲基化数据的工具包。它可用于探索来自牛津纳米孔直接DNA测序的读物的甲基化模式，并由包括纳米波利斯，F5C和Megalodon在内的呼叫者称为甲基化。该软件包中的图允许可视化实验组和基因组特征类别汇总的甲基化谱。
作者：Shian Su [Cre，Aut]
维护者：shian su
引用（从r内，输入引用（“纳米塞维兹”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ NanoMethviz”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“纳米塞维兹”）
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细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.2.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.12（R-4.0）（1。5年） |
| 执照 | Apache许可证（> = 2.0） |
| 要看 | R（> = 4.0.0），方法，GGPLOT2 |
| 进口 | CPP11（> = 0.2.5），readr，，，，S4VECTORS，，，，总结性特征，，，，生物兴奋，，，，BSSEQ，，，，福卡，，，，断言，，，，AnnotationDbi，，，，RCPP，，，，dplyr，，，，Data.Table，，，，E1071，，，，FS，，，，基因组机，，，，胶水，，，，林玛（> = 3.44.0），拼布，，，，purrr，，，，rlang，，，，rsqlite，，，，rsamtools，，，，秤，，，，Scico，统计Stringr，，，，蒂布尔，，，，花花公子，utils，用，，，，Zlibbioc |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | DSS，，，，mus.musculus，，，，同性恋，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试（> = 3.0.0），COVR |
| 系统要求 | C ++ 11 |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/shians/nanomethviz |
| BugReports | https://github.com/shians/nanomethviz/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | nanomethviz_2.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | nanomethviz_2.2.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | nanomethviz_2.2.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nanomethviz |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/nanomethviz |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/nanomethviz/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
