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NBSplice
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DOI:10.18129 / B9.bioc.NBSplice
检测差异拼接的负二项模型
生物导体版本:发布(3.12)
该软件包提出了一种基于异构体定量的差分剪接评价方法。它应用广义线性模型的负二项分布来推断异构体相对表达的变化。
作者:Gabriela A. Merino和Elmer A. Fernandez
维护者:加布里埃拉美利奴美利奴。在gmail.com gabriela33 >
引文(从R中输入引用(“NBSplice”)):
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!require ("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“NBSplice”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | NBSplice-vignette |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.8.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R(>= 3.5)，方法 |
| 进口 | 刨边机统计数据,质量,车,mppa,BiocParallel,ggplot2,reshape2 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.bdmg.com.ar |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | NBSplice_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | NBSplice_1.8.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | NBSplice_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NBSplice |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NBSplice |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NBSplice/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
