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NBAMSeq
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DOI:10.18129 / B9.bioc.NBAMSeq
RNA-Seq数据的负二项相加模型
Bioconductor版本:发行版(3.13)
高通量测序实验和差异表达分析是一种广泛应用的检测基因组生物标志物的方法。差异表达分析的一个基本步骤是建立基因计数和相关协变量之间的关联模型。NBAMSeq是一种基于广义相加模型的灵活的统计模型，允许在方差估计中跨基因共享信息。
作者:徐仁[aut, cre]，裴芬宽[aut]
维护人员:Xu Ren
引用(从R中，输入引用(“NBAMSeq”))：
安装
要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:
browseVignettes(“NBAMSeq”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | RNA-Seq数据的负二项相加模型 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.8.0 |
| 在Bioconductor公司 | BioC 3.9 (R-3.6)(2年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (>= 3.6)，SummarizedExperiment，S4Vectors |
| 进口 | DESeq2，mgcv-24年(> = 1.8),BiocParallel，genefilter，方法，统计 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown，testthat，ggplot2 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/reese3928/NBAMSeq |
| BugReports | https://github.com/reese3928/NBAMSeq/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 给我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | NBAMSeq_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | NBAMSeq_1.8.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | NBAMSeq_1.8.0.tgz |
| 源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/NBAMSeq |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NBAMSeq |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/NBAMSeq/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
