mscoreutils

doi:10.18129/b9.bioc.mscoreutils

用于质谱数据的核心用户

生物导体版本:版本(3.13)

Mscoreutils定义了质谱数据的低级功能,并且与任何高级数据结构无关。这些功能包括质谱处理函数(噪声估计,平滑,安装),定量聚合功能(中值抛光函数,可靠的摘要,...),缺少数据插补,数据归一化(Quantiles,vsn,...)以及MISC助理功能,用于质谱包中R内的高级数据结构。

作者:rformassspectrometry package维护器[cre],laurent gatto [aut],约翰内斯·雷纳[AUT],塞巴斯蒂安·吉布[AUT],Adriaan Sticker [CTB],Sigurdur Smarason [CTB],Thomas Naake [CTB],Josep Maria Badia Aparicio [CTB],迈克尔·威特(Michael Witting)[CTB]

维护器:rformassspectrometry package naverer

引用(从r内,输入引用(“ Mscoreutils”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mscoreutils”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Mscoreutils”)

html R脚本 用于质谱数据的核心用户
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(1年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.6.0)
进口 方法,S4VECTORS,,,,大量的,统计线索
链接 RCPP
建议 测试,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,roxygen2,,,,IMPUTELCMD,,,,,,,,规范,,,,pcamethods,,,,VSN,,,,预处理
系统要求
增强
URL https://github.com/rformassspectrometry/mscoreutils
BugReports https://github.com/rformassspectrometry/mscoreutils/issues
取决于我
进口我 msbackendmassbank,,,,msbackendmgf,,,,msfeatures,,,,MSNBase,,,,qfeatures,,,,SCP,,,,光谱,,,,XCMS
建议我 MSQROB2
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 mscoreutils_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 mscoreutils_1.4.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) mscoreutils_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mscoreutils
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/mscoreutils
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mscoreutils/
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