MsBackendRawFileReader

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendRawFileReader

质谱后端阅读赛默飞世尔科学原始文件

Bioconductor版本:发行版(3.16)

使用赛默飞世尔科技公司的NewRawFileReader . net库实现了spectrum包的MsBackend。该包泛化了由rawrr包引入的功能(Kockmann T. et al. (2020)) 本包中定义的方法应该扩展Spectra Bioconductor包。

作者:Christian Panse [aut, cre],托拜厄斯·科克曼[aut]

维护者:Christian Panse

引文(从R内,输入引用(“MsBackendRawFileReader”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager")::install("MsBackendRawFileReader")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MsBackendRawFileReader”)

超文本标记语言 R脚本 关于使用和扩展' MsBackendRawFileReader '后端。
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 安装

细节

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版本 1.4.0
在Bioconductor bio3.14 (R-4.1)(1年)
许可证 GPL-3
取决于 R(>= 4.1),方法,光谱(> = 1.5.8)
进口 MsCoreUtilsS4VectorsIRangesrawrr(>= 1.3.6), utils,BiocParallel
链接
建议 BiocStyle(> = 2.5),ExperimentHubMsBackendMgfknitr晶格mzRprotViz(> = 0.7),rmarkdown鞑靼(> = 1.5),testthat
SystemRequirements mono-runtime 4。x或更高(包括System。数据库)在Linux/macOS, . net框架(>= 4.5.1)在微软Windows。
增强了
URL https://github.com/fgcz/MsBackendRawFileReader
BugReports https://github.com/fgcz/MsBackendRawFileReader/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 MsBackendRawFileReader_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 MsBackendRawFileReader_1.4.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) MsBackendRawFileReader_1.4.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendRawFileReader
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendRawFileReader
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MsBackendRawFileReader/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendRawFileReader/
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支持»

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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网