MsBackendMsp

DOI:10.18129 / B9.bioc.MsBackendMsp

NIST msp文件的质谱数据后端

Bioconductor版本:发行版(3.16)

质谱(MS)数据后端,支持从NIST MSP格式(MSP)文件导入和处理MS/MS谱。支持从不同MSP * flavor *的文件中导入数据。此包中的对象为Bioconductor的Spectra包添加了对MSP文件的支持。因此,如果没有为MS数据处理提供完整基础设施的Spectra包,则不应该使用此包。

作者:Neumann Steffen [aut],约翰内斯·雷纳[aut, cre],迈克尔·威廷[ctb]

维护者:Johannes Rainer

引文(从R内,输入引用(“MsBackendMsp”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MsBackendMsp”)

超文本标记语言 R脚本 MsBackendMsp
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

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版本 1.2.0
在Bioconductor BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.1.0),光谱(> = 1.5.14)
进口 BiocParallelS4VectorsIRangesMsCoreUtils、方法、统计
链接
建议 testthatknitr(> = 1.1.0版),roxygen2BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMsp
BugReports https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMsp/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 MsBackendMsp_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 MsBackendMsp_1.2.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) MsBackendMsp_1.2.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) MsBackendMsp_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMsp
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendMsp
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/MsBackendMsp/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendMsp/
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