Bioconductor版本:发行版(3.16)
质谱(MS)数据后端,支持从NIST MSP格式(MSP)文件导入和处理MS/MS谱。支持从不同MSP * flavor *的文件中导入数据。此包中的对象为Bioconductor的Spectra包添加了对MSP文件的支持。因此,如果没有为MS数据处理提供完整基础设施的Spectra包,则不应该使用此包。
作者:Neumann Steffen [aut],约翰内斯·雷纳[aut, cre],迈克尔·威廷[ctb]
维护者:Johannes Rainer
引文(从R内,输入引用(“MsBackendMsp”)
):
要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“MsBackendMsp”)
超文本标记语言 | R脚本 | MsBackendMsp |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.15 (R-4.2)(0.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.1.0),光谱(> = 1.5.14) |
进口 | BiocParallel,S4Vectors,IRanges,MsCoreUtils、方法、统计 |
链接 | |
建议 | testthat,knitr(> = 1.1.0版),roxygen2,BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMsp |
BugReports | https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMsp/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MsBackendMsp_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | MsBackendMsp_1.2.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | MsBackendMsp_1.2.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | MsBackendMsp_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMsp |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendMsp |
生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/MsBackendMsp/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendMsp/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |