Bioconductor版本:发行版(3.13)
质谱(MS)数据后台支持从吉祥物通用格式(mgf)文件导入和导出MS/MS谱数据。在这个包中定义的对象应该与Spectra Bioconductor包一起使用。因此,这个包将mgf文件支持添加到spectrum包中。
作者:rformassspectra软件包维护人员[cre], Laurent Gatto [aut],约翰内斯·莱纳[法国]
,塞巴斯蒂安·吉布[au]
维护者:rformassspectra Package Maintainer < rformassspectrometry.org>
引用(从R中,输入引用(“MsBackendMgf”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“MsBackendMgf”)
超文本标记语言 | R脚本 | MsBackendMgf的描述和用法 |
参考手册 |
biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.13 (R-4.1)(< 6个月) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 4.1),光谱(> = 1.0) |
进口 | BiocParallel,S4Vectors,IRanges,MsCoreUtils,方法,统计 |
链接 | |
建议 | testthat,knitr(> = 1.1.0版),roxygen2,BiocStyle(> = 2.5.19),rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf |
BugReports | https://github.com/RforMassSpectrometry/MsBackendMgf/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | xcms |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | MsBackendMgf_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | MsBackendMgf_1.0.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | MsBackendMgf_1.0.0.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/MsBackendMgf |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MsBackendMgf |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MsBackendMgf/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |