MinimumDistance

DOI:10.18129 / B9.bioc.MinimumDistance

一个包在Case-Parent新创CNV检测三人小组

Bioconductor版本:版本(3.13)

分析新创拷贝数变异的三人小组从高维基因分型平台。

作者:罗伯特B Scharpf和Ingo Ruczinski

维护人员:罗伯特Scharpf < rscharpf jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MinimumDistance”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF	R脚本	新创检测拷贝数改变case-parent三人小组
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细节

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版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.10 (r - 2.15)(9年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5.0),VanillaICE(> = 1.47.1)
进口	方法,BiocGenerics,MatrixGenerics,Biobase,S4Vectors(> = 0.23.18),IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.17.16),SummarizedExperiment(> = 1.15.4),oligoClasses,DNAcopy,ff,foreach,matrixStats,晶格,data.table、网格数据,跑龙套
链接
建议	human610quadv1bCrlmm(> = 1.0.3),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,RUnit
SystemRequirements
增强了	雪,doSNOW
URL
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MinimumDistance_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	MinimumDistance_1.36.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	MinimumDistance_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MinimumDistance
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MinimumDistance
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MinimumDistance/
包下载报告	下载数据