米尼卡

doi:10.18129/b9.bioc.mineica

对基因组数据获得的ICA分解的分析

生物导体版本:版本(3.15)

Mineica的目的是在多个转录组数据集上执行独立的组件分析(ICA),并集成其他数据(例如分子,临床和病理)。这种集成的ICA通过研究其与变量(例如样品注释)和基因集的关联来帮助对组件的生物学解释,并可以使用基于相关的图进行比较来自不同数据集的组件。

作者:安妮·比顿

维护者:Anne Biton

引用(从r内,输入引用(“ mineica”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ mineica”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Mineica”)

PDF R脚本 Mineica:基因组数据的独立组件分析
PDF 参考手册

细节

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版本 1.36.0
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(9。5年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 2.10),方法,生物基因(> = 0.13.8),生物酶,,,,plyr,,,,GGPLOT2,,,,,,,,foreach,,,,Xtable,,,,Biomart,,,,gtools,,,,gostats,,,,,,,,Marray,,,,mclust,,,,rcolorbrewer,,,,色彩空间,,,,Igraph,,,,rgraphviz,,,,图形,,,,注释,,,,HMISC,,,,Fastica,,,,
进口 AnnotationDbi,,,,Lumi,,,,FPC,,,,Lumihumanall.db
链接
建议 Biomart,,,,gostats,,,,,,,,HGU133A.DB,,,,mclust,,,,Igraph,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,未来,,,,未来
系统要求
增强 DOMC
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

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源包 mineica_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 mineica_1.36.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) mineica_1.36.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mineica
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/mineica
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mineica/
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