生物导体版本:版本(3.15)
Mineica的目的是在多个转录组数据集上执行独立的组件分析(ICA),并集成其他数据(例如分子,临床和病理)。这种集成的ICA通过研究其与变量(例如样品注释)和基因集的关联来帮助对组件的生物学解释,并可以使用基于相关的图进行比较来自不同数据集的组件。
作者:安妮·比顿
维护者:Anne Biton
引用(从r内,输入引用(“ mineica”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ mineica”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
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Browsevignettes(“ Mineica”)
R脚本 | Mineica:基因组数据的独立组件分析 | |
参考手册 |
生物浏览 | bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 ,,,,bob 体育平台下载 |
版本 | 1.36.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(9。5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | R(> = 2.10),方法,生物基因(> = 0.13.8),生物酶,,,,plyr,,,,GGPLOT2,,,,秤,,,,foreach,,,,Xtable,,,,Biomart,,,,gtools,,,,gostats,,,,簇,,,,Marray,,,,mclust,,,,rcolorbrewer,,,,色彩空间,,,,Igraph,,,,rgraphviz,,,,图形,,,,注释,,,,HMISC,,,,Fastica,,,,玉 |
进口 | AnnotationDbi,,,,Lumi,,,,FPC,,,,Lumihumanall.db |
链接 | |
建议 | Biomart,,,,gostats,,,,簇,,,,HGU133A.DB,,,,mclust,,,,Igraph,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,乳腺癌,,,,未来,,,,未来 |
系统要求 | |
增强 | DOMC |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | mineica_1.36.0.tar.gz |
Windows二进制 | mineica_1.36.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | mineica_1.36.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mineica |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/mineica |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mineica/ |
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