MicrobiotaProcess

DOI:10.18129 / B9.bioc.MicrobiotaProcess

全面的R包管理和分析微生物和其他生态整理框架中的数据

Bioconductor版本:版本(3.16)

MicrobiotaProcess R包进行分析,可视化和生物标志物的发现微生物数据集。介绍了MPSE类,这使它更可互操作与现有计算生态系统。此外,它引入了一个整洁的微生物组数据结构范式和分析语法。它提供了各种各样的微生物组数据分析程序的统一和共同框架下(tidy-like框架)。

作者:Shuangbin徐(aut (cre),Guangchuang Yu (aut,施莱)

维护人员:徐Shuangbin < xshuangbin 163. com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MicrobiotaProcess”)

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文档

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细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.10.2
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	GPL (> = 3.0)
取决于	R (> = 4.0.0)
进口	猿,tidyr,ggplot2,magrittr,dplyr,Biostrings,ggrepel,素食主义者,动物园,ggtree,tidytree(> = 0.3.9),质量、方法、rlang,宠物猫,统计grDevices跑龙套,硬币,ggsignif,拼接而成,ggstar,tidyselect,SummarizedExperiment,foreach,treeio(> = 1.17.2),支柱,plyr,dtplyr,ggtreeExtra,data.table
链接
建议	rmarkdown,prettydoc,testthat,knitr,nlme,phangorn,解读,randomForest,jsonlite,biomformat,尺度,yaml,withr,S4Vectors,purrr,seqmagick,胶水,corrr,ggupset,ggVennDiagram,gghalves,ggalluvial(> = 0.11.1),forcats,cli,phyloseq,aplot,ggnewscale,ggside,ggh4x,hopach平行,shadowtext,DirichletMultinomial
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/YuLab-SMU/MicrobiotaProcess/
BugReports	https://github.com/YuLab-SMU/MicrobiotaProcess/issues
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包档案

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源包	MicrobiotaProcess_1.10.2.tar.gz
Windows二进制	MicrobiotaProcess_1.10.2.zip
macOS二进制(x86_64)	MicrobiotaProcess_1.10.2.tgz
macOS二进制(arm64)	MicrobiotaProcess_1.10.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MicrobiotaProcess
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MicrobiotaProcess
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MicrobiotaProcess/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MicrobiotaProcess/
包下载报告	下载数据
老BioC 3.16源码包	源存档