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MethylSeekR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MethylSeekR
Bis-seq数据的分割
生物导体版本:发布(3.13)
这是从Bis-seq数据中发现调节区域的软件包
作者:Lukas Burger, Dimos Gaidatzis, Dirk Schubeler和Michael Stadler
维护者:卢卡斯汉堡<卢卡斯。汉堡在fmi.ch >
引文(从R中输入引用(“MethylSeekR”)）：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!安装。packages("BiocManager")
有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“MethylSeekR”)
| R脚本 | MethylSeekR | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.32.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.12 (R-3.0)(8年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | rtracklayer(>= 1.15.3)， parallel (>= 2.15.1)，mhsmm(> = 0.4.4) |
| 进口 | IRanges(> = 1.16.3),BSgenome(> = 1.26.1),GenomicRanges(> = 1.10.5),geneplotter(> = 1.34.0)、图形(> = 2.15.2),grDevices(> = 2.15.2),并行(> = 2.15.2),数据(> = 2.15.2),跑龙套(> = 2.15.2) |
| 链接 | |
| 建议 | BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | methylPipe，RnBeads |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
| 源包 | MethylSeekR_1.32.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MethylSeekR_1.32.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | MethylSeekR_1.32.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MethylSeekR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MethylSeekR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MethylSeekR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
