MetaboAnnotation

DOI:10.18129 / B9.bioc.MetaboAnnotation

公用事业为代谢组学数据的注释

Bioconductor版本:版本(3.16)

高水平的功能,协助注释(代谢组学)的数据集。这些包括函数来执行简单的试探性的注释基于质量匹配还函数考虑m / z和注释的保留时间,质特性考虑到各自的参考价值。此外,该函数提供的高级功能简化了匹配的质/女士光谱与光谱库和对象和功能来表示和管理这样的匹配数据。

作者:迈克尔情报(aut),Johannes Rainer (aut (cre),安德里亚维克尼(aut)卡罗琳胡贝尔(aut),Nir Shachaf(施)

维护人员:约翰Rainer <约翰内斯。在eurac.edu Rainer >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MetaboAnnotation”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MetaboAnnotation”)

HTML	R脚本	MS-based代谢组学数据的注释
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0.0)
进口	BiocGenerics,MsCoreUtils,MetaboCoreUtils,ProtGenerics、方法、S4Vectors,光谱(> = 1.7.2),BiocParallel,SummarizedExperiment,QFeatures、图形、CompoundDb
链接
建议	testthat,knitr,msdata,BiocStyle,rmarkdown,情节,闪亮的,shinyjs,DT,AnnotationHub
SystemRequirements
增强了	RMariaDB,RSQLite
URL	https://github.com/RforMassSpectrometry/MetaboAnnotation
BugReports	https://github.com/RforMassSpectrometry/MetaboAnnotation/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MetaboAnnotation_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	MetaboAnnotation_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	MetaboAnnotation_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64)	MetaboAnnotation_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaboAnnotation
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MetaboAnnotation
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/MetaboAnnotation/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MetaboAnnotation/
包下载报告	下载数据