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MetaVolcanoR
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DOI:10.18129 / B9.bioc.MetaVolcanoR
基因表达元分析可视化工具
Bioconductor版本:发行版(3.16)
MetaVolcanoR结合差异基因表达结果。它采用三种策略来总结不同研究中的差异基因表达。i)随机效应模型(REM)方法，ii) p值组合方法，iii)投票计数方法。在所有情况下，MetaVolcano利用火山图推理可视化基因表达元分析结果。
作者:Cesar Prada [aut, cre]， Diogenes Lima [aut]， Helder Nakaya [aut, ths]
维护者:Cesar Prada < Cesar . Prada。Medina在gmail.com>
引文(从R内，输入引用(“MetaVolcanoR”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“MetaVolcanoR”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | MetaVolcanoR输入:差分表达式示例 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | MetaVolcanoR:差异表达元分析工具 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.12.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.1.1) |
| 进口 | 方法,data.table,dplyr,tidyr,情节,ggplot2,cowplot平行,metafor,metap,rlang,topconfects， grDevices，图形，统计，htmlwidgets |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,减价,rmarkdown,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | MetaVolcanoR_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MetaVolcanoR_1.12.0.zip(64位) |
| macOS二进制文件(x86_64) | MetaVolcanoR_1.12.0.tgz |
| macOS二进制文件(arm64) | MetaVolcanoR_1.12.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaVolcanoR |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MetaVolcanoR |
| 生物包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/MetaVolcanoR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MetaVolcanoR/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
