- 家
- Bioconductor 3.15
- 软件包
- MatrixRider
MatrixRider
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.MatrixRider
获得总亲和力和入住率对给定矩阵结合位点序列
Bioconductor版本:版本(3.15)
计算一个数字整整一个序列,反映了DNA结合蛋白相互作用的倾向。DNA结合蛋白与烤瓷矩阵描述,例如从Jaspar得到。
作者:埃琳娜格拉希
维护人员:埃琳娜·葛拉<葛。在gmail.com e >
从内部引用(R,回车引用(“MatrixRider”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MatrixRider”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“MatrixRider”)
| R脚本 | 亲和力和入住率 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.28.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.1 (r - 3.2)(7年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.1.2) |
| 进口 | 方法,TFBSTools,IRanges,XVector,Biostrings |
| 链接 | IRanges,XVector,Biostrings,S4Vectors |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,JASPAR2014 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | MatrixRider_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MatrixRider_1.28.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | MatrixRider_1.28.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MatrixRider |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MatrixRider |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MatrixRider/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
