Maaslin2
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doi：10.18129/b9.bioc.maaslin2
“人口量表元摩学研究中的多变量关联发现”
生物导体版本：版本（3.15）
Maaslin2是综合的R包，用于有效地确定临床元数据和微生物元元特征之间的多变量关联。MAASLIN2依靠一般线性模型来适应包括横截面和纵向在内的大多数现代流行病学研究设计，并提供各种数据探索，标准化和转化方法。Maaslin2是下一代Maaslin。
作者：Himel Mallick [AUT]，Ali Rahnavard [AUT]，Lauren McIver [AUT，CRE]
维护者：lauren mciver
引用（从r内，输入引用（“ Maaslin2”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Maaslin2”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Maaslin2”）
| html | R脚本 | Maaslin2 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 1.10.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.10（R-3.6）（2。5年） |
| 执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
| 要看 | R（> = 3.6） |
| 进口 | 鲁棒，，，，Biglm，，，，PCAPP，，，，EDGER，，，，元基因组，，，，rpsymphony，，，，pbapply，，，，车，，，，dplyr，，，，素食主义者，，，，化学计量学，，，，GGPLOT2，，，，pheatmap，，，，记录，，，，Data.Table，，，，lmertest，，，，哈希，，，，Optparse，grdevices，统计，utils，glmmtmb，，，，大量的，，，，CPLM，，，，PSCL，，，，LME4 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，测试（> = 2.1.0），rmarkDown |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://huttenhower.sph.harvard.edu/maaslin2 |
| BugReports | https://github.com/biobakery/maaslin2/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 马卡龙，，，，mmuphin |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | maaslin2_1.10.0.tar.gz |
| Windows二进制 | maaslin2_1.10.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | maaslin2_1.10.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/maaslin2 |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/maaslin2 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/maaslin2/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
