MWASTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.MWASTools

MWASTools:一个集成的管道执行metabolome-wide关联研究

Bioconductor版本:版本(3.15)

MWASTools执行metabolome-wide关联研究提供了一个完整的管道。包装的主要功能包括:质量控制分析metabonomic数据;mwa使用不同的关联模型(部分相关性;广义线性模型);使用非参数引导模型验证;的可视化mwa结果;使用STOCSY NMR代谢物鉴定;和生物mwa结果的解释。

作者:安德里亚·Rodriguez-Martinez约兰m . Posma拉斐尔•阿亚拉安娜l .七巧板Maryam安瓦尔,杰里米·k·尼科尔森Marc-Emmanuel杜马斯

维护人员:安德里亚Rodriguez-Martinez <安德里亚。rodriguez-martinez13 imperial.ac。英国>,拉斐尔Ayala <拉斐尔。阿亚拉在oist.jp >

从内部引用(R,回车引用(“MWASTools”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MWASTools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MWASTools”)

HTML R脚本 MWASTools
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载 ,bob 体育平台下载
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年)
许可证 CC BY-NC-ND 4.0
取决于 R (> = 3.5.0)
进口 glm2,ppcor,qvalue,,引导、网格ggplot2,gridExtra,igraph,SummarizedExperiment,KEGGgraph,RCurl,KEGGREST,ComplexHeatmap统计,跑龙套
链接
建议 RUnit,BiocGenerics,knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我 MetaboSignal
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 MWASTools_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 MWASTools_1.20.0.zip
macOS 10.13(高山脉) MWASTools_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MWASTools
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MWASTools
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MWASTools/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网