MSSTATSTMT
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doi：10.18129/b9.bioc.msstatstmt
基于shot弹枪质谱法的蛋白质显着性分析具有串联质量标签（TMT）标记的蛋白质组学实验
生物导体版本：版本（3.15）
该软件包提供了统计工具，用于检测基于shot弹枪质谱的蛋白质组学实验中具有串联质量标签（TMT）标签的差异丰富蛋白质。它提供了多种功能，包括AATA可视化，蛋白质定量和归一化以及统计建模和推理。此外，它与其他数据处理工具（例如蛋白质组发现者，Maxquant，OpenMS和Spectromine）相互处理。
作者：Ting Huang [AUT，CRE]，Meena Choi [aut]，Mateusz Staniak [aut]，Sicheng Hao [aut]，Olga Vitek [aut]
维护者：ting huang
引用（从r内，输入引用（“ MSSTATSTMT”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ MSSTATSTSTMT”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ msstatstmt”）
| html | R脚本 | MSSTATSTMT用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 ，，，，bob 体育平台下载 |
| 版本 | 2.4.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | R（> = 4.1） |
| 进口 | 林玛，，，，LME4，，，，lmertest， 方法，Data.Table，统计，utils，GGPLOT2，grdevices，图形，MSSTATS，，，，MSSTATSConvert，，，，检查员 |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://msstats.org/msstatstmt/ |
| BugReports | https://groups.google.com/forum/#! Forum/msstats |
| 取决于我 | |
| 进口我 | MSSTATSPTM |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | MSSTATSTMT_2.4.0.TAR.GZ |
| Windows二进制 | MSSTATSTMT_2.4.0.ZIP |
| MacOS 10.13（高山脉） | MSSTATSTMT_2.4.0.TGZ |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msstatstmt |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/msstatstmt |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/msstatstmt/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
