MSstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstats

无标签或基于标签的蛋白质组学实验中DDA、SRM和DIA的蛋白质显著性分析

Bioconductor版本:发行版(3.13)

一套用于DDA、SRM和DIA实验中统计相对蛋白显著性分析的工具。

作者:Meena Choi [aut, cre], Mateusz Staniak [aut],蔡宗衡[aut],黄婷[aut], Olga Vitek [aut]

维护者:Meena Choi

引文(从R内,输入引用(“MSstats”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MSstats")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MSstats”)

超文本标记语言 R脚本 MSstats:蛋白质/肽显著性分析
PDF 参考手册

细节

biocViews bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载 bob 体育平台下载
版本 4.0.1
在Bioconductor BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 4.0)
进口 MSstatsConvertdata.table使彻底失败质量limmalme4preprocessCore生存跑龙套,Rcppggplot2ggrepelgplotsmarray,统计,grDevices,图形,方法
链接 RcppRcppArmadillo
建议 BiocStyleknitrrmarkdownMSstatsBioDatatinytestcovr减价
SystemRequirements
增强了
URL http://msstats.org
BugReports https://groups.google.com/forum/ !论坛/ msstats
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包档案

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源包 MSstats_4.0.1.tar.gz
Windows二进制 MSstats_4.0.1.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) MSstats_4.0.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstats
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MSstats
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MSstats/
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