MSstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstats

无标签或基于标签的蛋白质组学实验中DDA、SRM和DIA的蛋白质显著性分析

Bioconductor版本:发行版(3.13)

一套用于DDA、SRM和DIA实验中统计相对蛋白显著性分析的工具。

作者:Meena Choi [aut, cre]， Mateusz Staniak [aut]，蔡宗衡[aut]，黄婷[aut]， Olga Vitek [aut]

维护者:Meena Choi

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MSstats")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MSstats”)

超文本标记语言	R脚本	MSstats:蛋白质/肽显著性分析
PDF		参考手册

细节

biocViews	bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载 ，bob 体育平台下载
版本	4.0.1
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)
进口	MSstatsConvert，data.table，使彻底失败，质量，limma，lme4，preprocessCore，生存跑龙套,Rcpp，ggplot2，ggrepel，gplots，marray，统计，grDevices，图形，方法
链接	Rcpp，RcppArmadillo
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，MSstatsBioData，tinytest，covr，减价
SystemRequirements
增强了
URL	http://msstats.org
BugReports	https://groups.google.com/forum/ !论坛/ msstats
全靠我
进口我	artMS，MSstatsPTM，MSstatsSampleSize，MSstatsTMT
建议我	MSstatsBioData，MSstatsTMTPTM
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MSstats_4.0.1.tar.gz
Windows二进制	MSstats_4.0.1.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	MSstats_4.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstats
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MSstats
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MSstats/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.13的旧源包	源存档