msnid.

DOI：10.18129 / b9.bioc.msnid.

勘探和评估LC-MSN蛋白质组学识别型勘探和评估公用事业

Bioconductor版本：释放（3.13）

从mzidentml（利用MzID包）或文本文件中提取MS / MS ID数据。在从多个数据集中整理搜索结果后，它会评估其识别质量并优化过滤标准，以实现最大识别数，同时不超过指定的错误发现率。还包含许多公用事业公司来探索MS / MS结果，并​​评估错过和不规则的酶切割，质量测量精度等。

作者：Vlad Petyuk与劳伦特·戈托的贡献

维护者：Vlad Petyuk

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“msnid”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

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Browsevignettes（“msnid”）

PDF.	r script.	使用msnid处理修改
PDF.	r script.	用于处理MS / MS标识的MSNID包
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载 那bob 体育平台下载
版本	1.26.0
在生物导体中以来	BIOC 3.0（R-3.1）（6.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 2.10），rcpp.
进口	msnbase.（> = 1.12.1），mzid.（> = 1.3.5），R.cache.那Foreach.那多达齐全，并行，方法，迭代器那data.table.那BioBase.那语言机构那重塑2.那dplyr.那MZR.那生物焦那msmstests.那ggplot2.那运行那生物根系那生物仪器那邮风那rlang.那stringr.那娇媚那annotationhub.那annotationdbi.那xtable.
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取决于我	蛋白质组学
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包档案包

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源包	msnid_1.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件	msnid_1.26.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	msnid_1.26.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/msnid.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ msnid
包短网址	https://biocumon.org/packages/msnid/
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